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WCG - FightAIDS@Home - Phase 2: Nuevo Proyecto
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Resumen:

The team behind FightAIDS@Home is launching Phase 2 of the project, putting to use a more accurate simulation tool to help them determine which of the Phase 1 results merit further investigation. Phase 2 will also be applying this analysis technique at an unprecedented scale, which if proven successful, can benefit medical research not only for HIV but many other diseases as well.

There have been some amazing advances in the fight against the human immunodeficiency virus (HIV), including treatments that have improved and extended millions of lives. But the fight continues - HIV is continually mutating, and as it does it evolves resistance to existing treatments. With tens of millions of people currently living with HIV, and millions more infected every year, the search for more effective HIV treatments is as critical as ever. Our team is therefore launching a new phase of HIV research to build on the success of the first phase and more accurately analyze the most promising drug candidates we've identified so far.

For almost a decade, FightAIDS@Home has contributed to this fight by exploring different ways of disabling the virus. World Community Grid members have provided my team an unprecedented amount of computing power, enabling us to investigate a huge number of potential cures. To date, volunteers have performed over 20 billion comparisons between candidate chemicals and different binding sites on the virus. Along the way, our team has improved the tools used in the fight, by developing - and validating - software tools to simulate chemical binding, and discovering new potential binding sites for drugs to attack. These tools have even supported other medical research efforts, both on World Community Grid and elsewhere.

The massive success of FightAIDS@Home has also generated a new challenge: thousands of potential 'hits' (chemicals that might form the basis of effective drugs) - a handful of which we're synthesizing for additional testing. But because there are so many, it is prohibitively expensive and time consuming to synthesize and lab test all of those chemicals. The project now needs a new computational method to double-check the promising Phase 1 results, and ensure that only the most thoroughly vetted and probable candidate compounds proceed for further investigation. Phase 2 of FightAIDS@Home will address both of these goals: refining the Phase 1 results and validating the technology needed to make more accurate simulations.

Specifically, Phase 2 uses a new analysis technique called BEDAM (Binding Energy Distribution Analysis Method), which is implemented using software called Academic IMPACT developed by our collaborators at Temple University. BEDAM has proven effective at carrying out more accurate simulations in computational contests, but thanks to World Community Grid volunteers, we now have an opportunity to apply it to analyze molecules at an unprecedented scale. This is important because if successful, these techniques can be applied to other drug discovery searches beyond HIV.

Phase 2 is more radical than its name suggests - World Community Grid volunteers have the opportunity to help us validate a new promising research paradigm that can help the search for treatments for many diseases, not just HIV. It's only because of the commitment shown by volunteers that FightAIDS@Home has been able to accomplish so much thus far. We hope we can count on your continued support as we continue this important journey.

To contribute to FightAIDS@Home - Phase 2, join World Community Grid, or if you are already a volunteer, make sure the project is selected on your My Projects page.




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Resumen:

El equipo de FightAIDS @ Home está detrás del lanzamiento de la Fase 2 del proyecto, utilizando una herramienta de simulación más precisa para ayudarles a determinar cuál de los resultados de la Fase 1, merecen una mayor investigación. La Fase 2 también se aplica a esta técnica de análisis en una escala sin precedentes, lo que si se prueba con éxito, puede beneficiar a la investigación médica, no sólo para el VIH, pera muchas otras enfermedades también.

Ha habido algunos avances asombrosos en la lucha contra el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH), que incluye los tratamientos que han mejorado y ampliado millones de vidas. Pero la lucha continúa - VIH está mutando continuamente y como lo hace evoluciona la resistencia a los tratamientos existentes. Con decenas de millones de personas que actualmente viven con el VIH, y millones más se infectan todos los años, la búsqueda de tratamientos más eficaces contra el VIH es tan crítica como siempre. Por tanto, nuestro equipo está poniendo en marcha una nueva fase de la investigación del VIH para construir sobre el éxito de la primera fase y analizar con mayor precisión los candidatos más prometedores de drogas que hemos identificado hasta ahora.

Durante casi una década, FightAIDS @ home ha contribuido a esta lucha para explorar diferentes maneras de deshabilitar el virus. Miembros de World Community Grid han aportado a mi equipo una cantidad sin precedentes de potencia de cálculo, lo que nos permite investigar un gran número de curas potenciales. Hasta la fecha, los voluntarios han realizado más de 20 mil millones de comparaciones entre productos químicos propuestos y diferentes sitios de unión en el virus. En el camino, nuestro equipo ha mejorado las herramientas utilizadas en la lucha, a través del desarrollo - y validar - herramientas de software para simular la unión química, y el descubrimiento de nuevos sitios de unión potenciales de los medicamentos para atacar. Estas herramientas incluso han apoyado otros esfuerzos de investigación médica, tanto sobre el World Community Grid y en otros lugares.

El éxito masivo de FightAIDS @ Home también ha generado un nuevo reto: miles de posibles 'hits' (sustancias químicas que podrían formar la base de medicamentos eficaces) - un puñado de los que estamos sintetizando para pruebas adicionales. Pero debido a que hay muchos, es prohibitivamente caro y consume tiempo para sintetizar y pruebas de laboratorio todos esos productos químicos. El proyecto necesita ahora un nuevo método computacional que compruebe los prometedores resultados de la Fase 1, y garantizar que sólo los compuestos candidatos más minuciosamente examinados y probables, procedan para una mayor investigación. La Fase 2 de FightAIDS @ Home abordará estos dos objetivos: el perfeccionamiento de la Fase 1 de los resultados y la validación de la tecnología necesaria para realizar simulaciones más precisas.


En concreto, la Fase 2 utiliza una nueva técnica de análisis llamado BEDAM (Binding Energy Distribution Analysis Method), que se realiza mediante un software llamado impacto académico desarrollado por nuestros colaboradores en la Universidad de Temple. BEDAM ha demostrado ser eficaz en la realización de simulaciones más precisas en concursos computacionales, pero gracias a los voluntarios de World Community Grid, ahora tenemos la oportunidad de aplicarlo para analizar moléculas en una escala sin precedentes. Esto es importante porque si tiene éxito, estas técnicas se pueden aplicar a otras búsquedas de descubrimiento de fármacos más allá del VIH.

La Fase 2 es más radical de lo que su nombre indica - los voluntarios de World Community Grid tienen la oportunidad de ayudar a validar un nuevo paradigma de investigación prometedora, que puede ayudar a la búsqueda de tratamientos para muchas enfermedades, no sólo el VIH. Es sólo por el compromiso mostrado por los voluntarios que FightAIDS @ Home ha sido capaz de lograr mucho hasta ahora. Esperamos poder contar con tu apoyo constante a medida que continuamos este importante viaje.

Para contribuir a FightAIDS @ Home - Fase 2, únete a World Community Grid, o si ya eres un voluntario, asegúrate de que el proyecto se ha seleccionado en la página Mi Proyectos.



Fuente: aquí.

Enviado el: 2/10/2015 18:09
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Re: WCG - FightAIDS@Home - Phase 2: Nuevo Proyecto
Simpatizante en Boinc
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Ya le estoy tirando y por ahora con 16 tareas los tiempos oscilan entre las 16-19 horas por tarea....

Enviado el: 3/10/2015 18:23
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Re: WCG - FightAIDS@Home - Phase 2: Nuevo Proyecto
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Ya tengo unas cuantas tareas, ahora a...

Enviado el: 6/10/2015 9:51
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Re: WCG - FightAIDS@Home - Phase 2: Nuevo Proyecto
Moderador
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Yo tengo algunas de 24 horas...

Enviado el: 6/10/2015 22:34
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