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WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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Uncovering Genome Mysteries:

From the realization that the Penicillium fungus kills germs, to the discovery of bacteria that eat oil spills and the identification of aspirin in willow tree bark, a better understanding of the natural world has resulted in many improvements to human health, welfare, agriculture and industry. This makes perfect sense: millions of organisms have already adapted over billions of years to nearly every condition imaginable, and by understanding how they've done so, we can perhaps use their strengths to benefit humankind. We already know of organisms with properties that could help solve some of the most pressing problems that human society faces, such as drug-resistant pathogens, pollution, and energy shortages. More are certainly out there, if we can find them. This area of study is still in its infancy: most of the organisms in Earth's biosphere have yet to be identified, let alone understood at the genetic level.

The first step in understanding the potential of an unknown organism is to decode its DNA sequence. This sequence reveals the organism's genes: the specific commands encoded in the DNA that control what each cell does and give life its amazing diversity. Understanding the genes and what they do is crucial to understanding the organism's role in the environment, as well as for the development of any potential medical and industrial applications as most of the proteins we find in a cell are enzymes. Enzymes are involved in breaking down food into useful components and building all kinds of molecules that the cell needs to survive.

Because of recent advances in DNA sequencing technology, it is now possible to decode organisms' DNA very rapidly and identify their genes. However, the next step--understanding the function of each gene and the protein it encodes--is much more complex, making it very difficult to do so on a large scale.



Uncovering Genome Mysteries plans to change that by examining close to 200 million genes from a wide variety of life forms, such as microorganisms found on seaweeds from Australian coastlines and in the Amazon river. The predicted proteins they encode will be compared against each other to assess their similarity. When two proteins are similar, and the function of one protein is already known, this similarity allows scientists to make educated predictions about the function of the other.



The scale of the task is staggering. It is only feasible thanks to the massive computational power of World Community Grid. While sequences from all forms of life will be processed, microorganisms will receive a special focus. Learn More.



Uncovering Genome Mysteries will create and publish a database of protein sequence comparison information for all scientists to reference.




Once published, these results should help scientists with the following tasks:

•Discovering new protein functions and augmenting knowledge about biochemical processes in general

•Identifying how organisms interact with each other and the environment

•Documenting the current baseline microbial diversity, allowing a better understanding of how microorganisms change under environmental stresses, such as climate change

•Understanding and modeling complex microbial systems

In addition, a better understanding of these organisms and their proteins and enzymes will likely be useful in developing new medicines, harnessing new sources of renewable energy, improving nutrition, cleaning the environment, creating green industrial processes and many other advances.



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A partir de la constatación de que el hongo Penicillium elimina los gérmenes, al descubrimiento de las bacterias que se alimentan de vertidos de petróleo y la identificación de la aspirina en la corteza de árboles de sauce, una mejor comprensión del mundo natural, ha dado lugar a muchas mejoras para la salud humana, el bienestar, la agricultura y la industria . Esto tiene mucho sentido: millones de organismos ya se han adaptado durante miles de millones de años en casi todas las condiciones imaginables, y mediante la comprensión de cómo lo han hecho así, tal vez podamos usar sus puntos fuertes para beneficiar a la humanidad. Ya sabemos de organismos con características que podrían ayudar a resolver algunos de los problemas más acuciantes que enfrenta la sociedad humana, como los patógenos resistentes a los medicamentos, la contaminación y la escasez de energía. Sin duda, es ahí fuera donde podemos encontrarlos. Esta área de estudio se encuentra todavía en sus inicios: la mayoría de los organismos en la biosfera de la Tierra aún no se han identificado, y mucho menos entendido en el nivel genético.

El primer paso en la comprensión del potencial de un organismo desconocido es decodificar su secuencia de ADN. Esta secuencia revela los genes del organismo: los comandos específicos codificados en el ADN que controlan la función de cada célula y dar vida a su increíble diversidad. La comprensión de los genes y lo que hacen es crucial para entender el papel del organismo en el medio ambiente, así como para el desarrollo de las aplicaciones médicas e industriales potenciales como la mayoría de las proteínas que encontramos en una célula son enzimas. Las enzimas están implicadas en la descomposición de los alimentos en componentes útiles y la construcción de todo tipo de moléculas que la célula necesita para sobrevivir.

Debido a los recientes avances en la tecnología de secuenciación de ADN, ahora es posible decodificar ADN organismos 'muy rápidamente e identificar sus genes. Sin embargo, el siguiente paso - la comprensión de la función de cada gen y la proteína que codifica - es mucho más compleja, por lo que es muy difícil hacerlo a gran escala.



Uncovering Genome Mysteries tiene previsto cambiar esto mediante el examen de cerca de 200 millones de genes a partir de una amplia variedad de formas de vida, tales como microorganismos que se encuentran en las algas marinas de las costas de Australia y en el río Amazonas. Las proteínas que se prevén codificar, se compararán entre sí para determinar su similitud. Cuando dos proteínas son similares, y la función de una proteína ya se sabe, esta similitud permite a los científicos hacer predicciones educadas sobre la función de la otra.



La amplitud de la tarea es enorme. Es sólo viable gracias al poder computacional masivo de World Community Grid. Mientras se procesan las secuencias de todas las formas de vida, los microorganismos recibirán una atención especial. Aprenderemos mucho más.



Uncovering Genome Mysteries creará y publicará una base de datos con información de la comparación de secuencias de proteínas para todos los científicos de referencia.




Una vez publicados, estos resultados deberían ayudar a los científicos con las siguientes tareas:

•El descubrimiento de nuevas funciones de las proteínas y aumentar el conocimiento acerca de los procesos bioquímicos en general

•Identificar cómo los organismos interactúan entre sí y el medio ambiente

•La documentación de la diversidad microbiana de referencia actual, lo que permite una mejor comprensión de cómo los microorganismos cambian bajo las tensiones ambientales, como el cambio climático

•La comprensión y el modelado de sistemas microbianos complejos

Además, una mejor comprensión de estos organismos y sus proteínas y enzimas probablemente será útil en el desarrollo de nuevos medicamentos, el aprovechamiento de nuevas fuentes de energía renovables, la mejora de la nutrición, la limpieza del medio ambiente, la creación de procesos industriales verdes y muchos otros avances.

Enviado el: 16/10/2014 22:58
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Re: WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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¿Tienes las URL del proyecto y del equipo? El proyecto parece muy muy interesante. Gracias por la aportación

Enviado el: 17/10/2014 8:39
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Re: WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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Acotación:

Agus_ escribió:
¿Tienes las URL del proyecto y del equipo? El proyecto parece muy muy interesante. Gracias por la aportación


Hola: Es de WCG y la url directa es: WCG-UnGeMy es sólo para CPU. Saludos.

Enviado el: 17/10/2014 12:29
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Re: WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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Como comenta Carlesa es directa, tan solo tienes que seleccionar el subproyecto en la web de WCG - Mi contribución - Mis proyectos.


Enviado el: 17/10/2014 16:16
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Re: WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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Genial! Hacía tiempo que no había nuevo subproyecto en WCG.

Enviado el: 17/10/2014 19:55
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Re: WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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Parece que ya está casi arreglado el problema de la escritura en el disco duro. El arreglo está ahora en fase alfa y pronto estará disponible en la versión oficial.

Enviado el: 15/11/2014 11:20
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Re: WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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Hola,

Ya he alcanzado la medalla de diamante 5. ¡Yujuuu!!!
Ahora vendrá cazamarcianos y nos enseñará un monton a 100, jejeje.

Saludos.

Enviado el: 14/4/2016 17:27
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Re: WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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Enhorabuena!!,

A mantener el ritmo para llegar a diamante 10 , y más allá

Enviado el: 15/4/2016 12:34
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Re: WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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A este ritmo, este proyecto finaliza en 88 días¡¡
http://s137.photobucket.com/user/Seke ... rsPi1Project.png.html?502

Enviado el: 15/4/2016 15:44
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Re: WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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Jejeje, a 10 no llego ¡no me da tiempo!

Ahora a por la de 5 en Maping Cancer Makers, a esta si llegaré. Espero.

Si, a este proyecto le falta un suspiro, y al del ébola también.

http://www.worldcommunitygrid.org/res ... ent=panel-button-projects


Enviado el: 15/4/2016 16:06
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Re: WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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¿Como acceden a los graficos que se muestran en el enlace de ljfc2001?
(nunca recuerdo como citar respuestas de usuarios)

¿Cuantas pcs tienen procesando? Yo actualmente tengo mi antigua pc AMD FX 8350 + Nvidia GTX 660 procesando para GPUGrid y todos los proyectos CPU menos WCG y la nueva pc i7 6700K + Asus Nvidia GTX 970 procesando para GPUGrid y WCG.

Enviado el: 15/4/2016 22:20
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Re: WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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A mi el link de lfc... me funciona simplemente clickando en el. Pero está un poco desactualizado, igual es ese el problema.

PC... solo uno desde hace tiempo, pero como me hace 12 procesos a la par, aún me da para defenderme en el WCG. No me da para más proyectos.

Enviado el: 16/4/2016 11:30
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Re: WCG - Uncovering Genome Mysteries: Nuevo proyecto
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Es un link que tiene Sekerob de WCG con estadísticas:

http://s137.photobucket.com/user/Sekerob/slideshow/Daily?sort=3

Yo tengo 3, un Quad a 2.4 Ghz, un core dos duo 3.2 ó 3.0 Ghz y uno con tres cores a 2.2 Ghz, mas o menos...No están encendidos todo el día.

Enviado el: 16/4/2016 15:32
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