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WCG - Mapping Cancer Markers: Nuevo proyecto
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Mapping Cancer Markers:

Cancers, one of the leading causes of death worldwide, come in many different types and forms in which uncontrolled cell growth can spread to other parts of the body. Unchecked and untreated, it can ultimately lead to death. The disease is caused by genetic or environmental changes that interfere with biological mechanisms that control cell growth. These changes, as well as normal cell activities, can be detected in tissue samples through the presence of their unique chemical indicators, such as DNA and proteins, which together are known as "markers." Specific combinations of these markers may be associated with a given type of cancer.

The pattern of markers can determine whether an individual is susceptible to developing a specific form of cancer, and may also predict the progression of the disease, helping to suggest the best treatment for a given individual. For example, two patients with the same form of cancer may have different outcomes and react differently to the same treatment due to a different genetic profile. While several markers are already known to be associated with certain cancers, there are many more to be discovered, as cancer is highly heterogeneous.

Mapping Cancer Markers on World Community Grid aims to identify the markers associated with various types of cancer. The project is analyzing millions of data points collected from thousands of healthy and cancerous patient tissue samples. These include tissues with lung, ovarian, prostate, pancreatic and breast cancers. By comparing these different data points, researchers aim to identify patterns of markers for different cancers and correlate them with different outcomes, including responsiveness to various treatment options.


This knowledge can help researchers and physicians to:

Improve and personalize cancer treatment: by making it possible to detect cancer earlier, identify high-risk patients, and to customize treatment based on a patient's personal genetic profile. Accelerate cancer research and improve the overall process for identifying markers: by refining the process of identifying markers, researchers can determine an individual patient's markers more easily, and future large sets of data can be analyzed more efficiently.




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Mapeo de marcadores de Cancer:


El cáncer , una de las principales causas de muerte en el mundo, viene dada en muchos tipos y formas en las que el crecimiento celular descontrolado puede extenderse a otras partes del cuerpo diferentes. Sin control y si no se trata, en última instancia, puede conducir a la muerte . La enfermedad es causada por los cambios genéticos o ambientales que interfieren con los mecanismos biológicos que controlan el crecimiento celular . Estos cambios, así como las actividades normales de la célula, se pueden detectar en las muestras de tejido a través de la presencia de sus indicadores químicos únicos , como el ADN y las proteínas , que en conjunto se conocen como " marcadores ". Las combinaciones específicas de estos marcadores pueden estar asociados con un determinado tipo de cáncer.

El patrón de los marcadores puede determinar si un individuo es susceptible a desarrollar una forma específica de cáncer, y también puede predecir la progresión de la enfermedad, ayudar a sugerir el mejor tratamiento para un individuo dado. Por ejemplo, dos pacientes con el mismo tipo de cáncer pueden tener diferentes resultados y reaccionar de manera diferente a la misma, el tratamiento debido a un perfil genético diferente. Sabemos que varios marcadores están asociados con ciertos tipos de cáncer, hay muchos más por descubrir, el cáncer es altamente heterogéneo.

El mapeo de marcadores de cáncer de World Community Grid tiene como objetivo identificar los marcadores asociados con varios tipos de cáncer. El proyecto está analizando millones de datos puntuales recogidos de miles de muestras de tejido de pacientes sanos y cancerosos. Estos incluyen los tejidos con cáncer de pulmón, de ovario, de próstata, de páncreas y de mama. Mediante la comparación de estos datos puntuales, los investigadores tienen por objetivo identificar patrones de marcadores para diferentes tipos de cáncer y correlacionarlos con diferentes resultados, incluyendo la capacidad de respuesta a diferentes opciones de tratamiento.


Este conocimiento puede ayudar a los investigadores y médicos a:

Mejorar y personalizar el tratamiento del cáncer: por lo que es posible detectar el cáncer de forma temprana, identificar a los pacientes de alto riesgo y personalizar el tratamiento en función del perfil genético de un paciente.

Acelerar la investigación del cáncer y mejorar el proceso general para la identificación de los marcadores: perfeccionar el proceso de identificación de los marcadores, los investigadores pueden determinar los marcadores de cada paciente con mayor facilidad, y los futuros grandes conjuntos de datos podrán ser analizados de manera más eficiente.


*Traducido de manera artesanal por J. para C@B, no recurriendo por ello a otros métodos "menos ortodoxos".



Medallas (Badges):

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Url proyecto: https://secure.worldcommunitygrid.org/research/mcm1/overview.do

Url foro: http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/listthreads?forum=600

Url website: http://www.cs.utoronto.ca/~juris/MCM.htm



Enviado el: 9/11/2013 15:43

Editado por ljfc2001 enviado el 26/11/2013 15:50:55
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Re: WCG - Mapping Cancer Markers: Nuevo proyecto
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Hemos puesto en marcha el proyecto Mapping Cancer Markers esta semana, y aceleramos el primer lote para que pudiéramos comprobar los resultados antes de cualquier anomalía. Por desgracia, nos encontramos con una limitación en el generador de números aleatorios por defecto, que se utiliza para el proyecto. El aumento del volumen de los resultados reveló una duplicación de la computación debido a esto. Es decir, los resultados calculados son válidos y correctos, pero en algunos casos se duplican en lugar de explorar nuevas regiones de búsqueda.

Por esta razón, detenemos temporalmente el proyecto y haremos algunos cambios en el código para mejorar el uso del generador de números aleatorios. Vamos a realizar una prueba beta breve sobre estos cambios, y si todo va bien, pronto ( en pocos días ) retomaremos el proyecto a toda velocidad.

La naturaleza de la investigación a menudo contiene sorpresas inesperadas y esto es sólo una de ellas. Los miembros recibirán los créditos normales por el trabajo ya realizado.

Gracias por vuestras contribuciones y el apoyo al proyecto y lo que es más importante, daros las gracias por vuestra paciencia con esto.

Enviado el: 13/11/2013 13:23
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Re: WCG - Mapping Cancer Markers: Nuevo proyecto
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Proyecto restablecido y retocado.

Enviado el: 26/11/2013 15:51
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Re: WCG - Mapping Cancer Markers: Nuevo proyecto
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De momento parece que no dan ningún problema. El tiempo de cálculo anda entorno a las 5 horas y media o 7 horas y media según las unidades.

Enviado el: 26/11/2013 22:38
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Si no te das el placer de conocerme, no podras darte el lujo de olvidarme
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Re: WCG - Mapping Cancer Markers: Nuevo proyecto
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Yo ya tengo mi medallita de los primeros 14 días de cómputo jeje.

Enviado el: 27/11/2013 9:42
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