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RiojaScience@home: Nuevo proyecto
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Introducción:

Rioja Science es un proyecto de computación distribuida voluntaria, nacida entre la colaboración de Knet Comunicaciones y la Universidad de la rioja, con los departamentos de Matemáticas y de Químicas.
Esta pensado para ser una plataforma para la investigación biomédica mediante el uso de la computación distribuida voluntaria, en donde la infraestructura computacional esta en manos de voluntarios que ceden los ciclos que no usan de sus maquinas, para el aprovechamiento en la investigación biomédica.
Para conseguir estos objetivos nos basamos en el uso de BOINC, en la parte de Servidor que nos permite gestionar a los usuarios que quieren usar la plataforma, los programas que forman parte del proyecto y que se entregan a estos usuarios, con la gestión de las actualizaciones, y de los medios que se usan, y por ultimo las unidades de datos que se entregan al usuario final para que procesen o calculen y se obtenga los resultados, por ultimo estos resultado se mandan de nuevo a al servidor.


¿Qué es BOINC?:

En términos simples, es un software que te permite colaborar con tu computador en muchos proyectos científicos del mundo. Tan sólo necesitas un computador, una conexión a Internet y el Software gratuito BOINC. Esto se llama Computación Distribuida, la cual ocupa tu tiempo computacional disponible para procesar información científica del proyecto que tú elijas. El programa BOINC trabaja como fondo de pantalla, por tanto puedes usarlo normalmente.
Con esto, tú ayudas a las investigaciones científicas en muchas áreas, incluyendo Física, Química, Biología, Medicina, Matemáticas, Astronomía, etc.

Más info en:
http://boinc.berkeley.edu/

Más información detallada en:
http://es.wikipedia.org/wiki/Berkeley ... ure_for_Network_Computing


¿Qué aporta Rioja Science?:

En el Proyecto Rioja Science pretendemos usar esta tecnología para realizar complejos cálculos en proyectos de moléculas, problemas que gestionara el departamento de Químicas de la universidad de La Rioja, y para su implementación en el programa, y creación de los algoritmos matemáticos necesarios para su desarrollo, se apoyaran en el departamento de Matemáticas.
Por último Knet comunicaciones gestiona y proporciona y dota todos los recursos necesarios en la parte de servidores gracias a sus años de experiencia en el uso de plataformas open como Linux, u en la implementación de dimensionamiento de la infraestructura necesarios para este proyecto.


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RiojaScience@home:


RiojaScience@home es una iniciativa conjunta de la empresa Knet Comunicaciones y la Universidad de La Rioja con el objetivo de proporcionar a los grupos de investigación riojanos una plataforma de cómputo intensivo, muy superior a la que disponen actualmente en sus ordenadores personales o estaciones de trabajo. La iniciativa ha contado con financiación de la Agencia de Desarrollo Económico de La Rioja (ADER) y de la propia Universidad de La Rioja. Con el tiempo, esta plataforma podría llegar a ser el computador más potente de la Comunidad.


La potencia de cálculo de esta nueva infraestructura se basa en dos conceptos claves. Por una parte, la infraestructura está diseñada para que usuarios particulares, de forma voluntaria, puedan ceder el uso de sus ordenadores cuando no los estén utilizando. De esta forma, cuantos más usuarios cedan sus equipos más capacidad de cálculo alcanzará la plataforma. Las personas interesadas podrán suscribirse al proyecto a través de la web www.riojascience.com.


Por otra parte, se podrá aprovechar la capacidad de cálculo de las tarjetas gráficas de los ordenadores, también llamadas GPU y utilizadas principalmente para procesamiento de imágenes. En aquellos ordenadores que dispongan de GPU, será esta tarjeta la que realice las operaciones matemáticas, pudiendo acelerar entre 5 y 20 veces los cálculos realizados tradicionalmente por la unidad central de proceso (la CPU).


Las aplicaciones de RiojaScience@home son muy variadas. Pueden ir desde la búsqueda de vida inteligente en el espacio (objetivo del proyecto Seti@home), hasta la investigación en nuevos fármacos, pasando por mejorar las predicciones meteorológicas o simular el comportamiento de proteínas.
El primer proyecto científico en el que va a trabajar RiojaScience@home pertenece al ámbito de la Física y la Química. Se trata de un proyecto del Grupo de Investigación de Cinética y Dinámica de las Reacciones Químicas de la Universidad de La Rioja. Se estudiarán reacciones en fase gas y en disolución, en concreto se estudiará la dinámica molecular del narlaprevir, un posible medicamento para la enfermedad de la hepatitis C.



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Plataformas:

Microsoft Windows (98 or later) running on an Intel x86-compatible CPU

Linux running on an Intel x86-compatible CPU

Mac OS 10.4 or later running on Intel



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Url proyecto: http://boinc.riojascience.com/

Url equipo: http://boinc.riojascience.com/team_display.php?teamid=5

Server Status: http://boinc.riojascience.com/server_status.php

Enviado el: 2/5/2012 15:58

Editado por ljfc2001 enviado el 3/5/2012 22:53:22
Editado por ljfc2001 enviado el 24/5/2012 18:29:44
Editado por ljfc2001 enviado el 24/5/2012 18:40:47
Editado por ljfc2001 enviado el 18/9/2012 18:21:49
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
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Ahora mismo tengo un 10% de unidades erróneas y el 90% restante pendiente de validación.

Enviado el: 2/5/2012 17:24
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
Guest_
Holas


Te pasa como a mi 125 unidades pendientes y 10 errores. Las unidades son de muy poco tiempo 45segundos mas o menos.

saludos

Enviado el: 2/5/2012 17:31
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
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En un equipo con xp 32, me las está dando erróneas y en otro con 7 64, una que ha hecho, pendiente de validar.

Enviado el: 2/5/2012 17:33
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
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Mantengo la media de un 10%: de 770, 76 son erróneas y el resto pendiente.

Enviado el: 2/5/2012 21:00
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
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He comenzado a procesar en este proyecto, aunque parece que a vosotros os está dando muchos problemas.
Esperemos que se solucionen. Es bonito poder ayudar a proyectos de Universidades Españolas.

Enviado el: 3/5/2012 8:26
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
Guest_
holas

Los procesadores AMD con este proyecto no se llevan bien. Los dos ordenadores que tengo con procesadores de esta marca dan todas las unidades con fallos.

Procesadores:
AMD FX(tm)-8120 Eight-Core
AMD Athlon(tm) 64 X2 Dual Core Processor 4200+

Saludos

Enviado el: 3/5/2012 15:02
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
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Tiene razon Morox !!

Es curioso pero con el AMD 1055T con Win7 x64 da error :

Stderr output

<core_client_version>7.0.25</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
- exit code 195 (0xc3)
</message>
<stderr_txt>
wrapper: starting
15:16:33 (5652): wrapper: running ../../projects/boinc.riojascience.com/triqct_windows_intelx86_14.exe ()
app exit status: 0x1
15:16:34 (5652): called boinc_finish

</stderr_txt>
]]>


pero en otra maquina con un I3 2100 tambien con Win7 X64 las unidades acaban correctamente. Efectivamente el proyecto no se lleva bien con los micros AMD. Es todo un misterio, por lo menos de momento. Es como si el ejecutable de la aplicacion estuviera compilado "solo" para Intel, o que usara algun juego de instrucciones solo presente en los micros Intel.

Saludos

Enviado el: 3/5/2012 15:25
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
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Yo pensé que era por los 32 bits, pero coincido contigo, en un Amd todas erróneas:

AuthenticAMD
AMD Athlon(tm) II X2 255 Processor [Family 16 Model 6 Stepping 2]

Enviado el: 3/5/2012 15:54
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
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Hola a todos

me pueden explicar porque se hace una nueva plataforma multi-proyectos desde la infrainstructura cuando ya existe Ibercivis ?

Alguien sabe que es ese "Knet" empresa ?

Ese medicamento narlaprevir que se propone estudiar el primer proyecto, parece reciente por lo que dice google, no pertenece a una empresa ?

Tengo una curiosa impresion acerca de todo esto... ? o me estoy inventando historias ?

Enviado el: 3/5/2012 20:32
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
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Hola JeromeC, me alegra verte por aqui de nuevo.

Aunque Ibercivis sea el mayor proyecto multiplataforma de nuestro pais, no signica que sea el único. Hay otros proyectos en España como los que llevan en Falua, o este nuevo que acaba de surgir.

Por lo que he podido ver, no está totalmente al margen de Ibercivis. Desde la Fundación Ibercivis están expandiendo los contactos y fomentando el nacimiento de nuevas investigaciones dentro y fuera de España.

Yo supongo que igual que hay investigadores con menos recursos e infraestructuras que envían sus proyectos para que sea la propia Ibercivis quien lo lance, hay centros universitarios y centros de investigación que quieren tener su propia infraestructura y lo que hacen es colaborar con Ibercivis, pero lanzando su propio proyecto.

Tengo la sensación de que éste es uno de esos casos, ya que algunas de las ramas de crecimiento dentro de la Fundación Ibercivs reciben nombres como "Civis Portugal", "Civis Brasil" o "Civis La Rioja".

Con esto NO quiero decir que RiojaScience pertenezca a la red de Ibercivis, solo digo que Ibercivis está no solo para lanzar sus propios proyectos, si no también para ayudar y apoyar nuevas iniciativas.


De todas formas, todo esto que te digo no dejan de ser conjeturas mias basadas en la información que he visto publicada y en comentarios que se hicieron en el workshop de Ibercivis el año pasado. Estoy intentando contactar con uno de los programadores para que nos dé información mas exacta y detallada.



Enviado el: 4/5/2012 12:17
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
Simpatizante en Boinc
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Muchas gracias por la información, de mi lado he leído un poco mas lo que encontré en el net, ahora entiendo que Knet es un provider internet (o algo cerca) y el propósito del primer proyecto es noble :

"En concreto, es un proyecto del Grupo de Investigación de Cinética y Dinámica de las Reacciones Químicas de la Universidad de La Rioja, que estudia reacciones en fase gas y en disolución; más particularmente, la dinámica molecular del narlaprevir, un medicamento en estudio para la cura de la hepatitis C."

Me parecía extraño lo del parecido con ibercivis pero tus explicaciones son muy claras, gracias !


Otro tema, tenemos une noticia algo dolorosa del lado de l'AF : acaba de fallecer de forma muy repentina un destacado miembro de l'AF, Jip.

Le vamos a dedicar nuestra participación al Pentathlon 2012 organizado por Seti Germany.

Enviado el: 4/5/2012 13:54
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
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Lamento muchísimo leer esa noticia JeromeC. Te ruego transmitas nuestro pesar a todos los compañeros de l'AF, y a los familiares de Jip si tienes ocasión.

Recibe un fuerte abrazo.

Enviado el: 4/5/2012 14:10
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
Simpatizante en Boinc
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Gracias, sera transmitido, uno de los miembros (al menos) va a estar mañana en la cremacion cerca de Bordeaux.

Enviado el: 4/5/2012 20:39
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Re: RiojaScience@home: Nuevo proyecto
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me tambien yo siento el lamentable acontecimiento, mi mas sentido pesame para los seres queridos de Jip, aunque no tuve el gusto de conocerle, una gran perdida para la humanidad.

curiosamente mañana estare por cestas a descargar.

Enviado el: 6/5/2012 11:55
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sabes vivir?? aprovecha tu sabiduria...!!!!
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