About SBGrid:

SBGrid brings together more than 160 like-minded laboratories all in the business of discovering what biological molecules look like and how they work. The Consortium includes X-ray crystallography, NMR and electron microscopy laboratories worldwide. Members share the costs of SBGrid's support services and gain access to 227 scientific applications and extensive computing resources, all maintained at the SBGrid Service Center located at Harvard Medical School.

With the support that comes from SBGrid, labs are able to focus their attention on science, not on maintaining software and scheduling compute time. SBGrid eliminates the need for a dedicated software technician in large structural biology groups and it enables smaller, less specialized groups to create sustainable structural biology research programs. In total, SBGrid's support model saves its members $2 million per year or more.

SBGrid Services and Resources:

SBGrid's NIH-compliant Service Center supports SBGrid operations and provides members with access to the following services and resources:

Software Maintenance: The SBGrid Center manages the support cycles of 227 scientific applications, which includes:

Application evaluation, compilation, selection and licensing; deployment across the 166 Consortium laboratories on over 2100 workstations; ongoing support for over 1700 end users; maintenance, upgrades and bug fixes for all applications; and
rapid transition to new applications, versions, interim releases and supported operating systems.

Computing Access: Because discovering a crystal structure often requires access to extensive computing resources, SBGrid began a National Science Foundation sponsored Research Coordination Network in 2007 that provides a specialized computing portal that SBGrid members use to access the Open Science Grid.

Training: To keep Consortium members informed about the latest advancements in structural biology computing, SBGrid holds monthly WebEx seminars and an annual Computing School, called the Advances in Structural Biology Computing Symposium.

SBGrid Developer Network

The SBGrid Consortium works closely with the software developers who design and develop the tools structural biologists need. Because these developers also live and work around the world, integrating their diverse software tools can be challenging. SBGrid helps by providing resources, tools and an extensive developers' network of 20 virtual machines for building and testing applications and integration.

SBGrid Members continually consult with developers about their computing needs for future projects. Several developers participate in our advisory committee and SBGrid computing schools and visit us onsite.

Participants at our most recent advisory meeting, held in June 2011 and featuring several days of presentations and discussions, included the developers of HKL, Coot, Phenix, Solve/Resolve, CCP4, SHELX and Schrodinger, all key structural biology applications. Representatives from four US Synchrotrons also participated.

The effect of the SBGrid support model has been dramatic for its subscribing member laboratories. SBGrid support has eliminated the need for a dedicated software support technician in large structural biology research groups, while also helping enable smaller and less specialized groups to create sustainable structural biology research programs. Our conservative estimate of the aggregate savings realized by the project is at minimum at $2,000,000/year.






Acerca de SBGrid

SBGrid reúne a más de 160 laboratorios de ideas afines en todo el negocio de descubrir lo que las moléculas biológicas parecen y cómo funcionan. El Consorcio incluye cristalografía de rayos X, RMN y los laboratorios de microscopía electrónica en todo el mundo. Los miembros comparten los gastos de servicios de apoyo SBGrid y tener acceso a 227 aplicaciones científicas y gran cantidad de recursos de computación, todos mantenidos en el Centro de Servicio SBGrid ubicado en la Harvard Medical School.

Con el apoyo que viene de SBGrid, los laboratorios son capaces de centrar su atención en la ciencia, no en el mantenimiento de software y la programación de tiempo de cálculo. SBGrid elimina la necesidad de un técnico de software dedicado en grandes grupos de la biología estructural y permite que grupos más pequeños y menos especializados para crear programas sostenibles de investigación de la biología estructural. En total, el modelo de apoyo SBGrid ahorra a sus miembros $ 2 millones por año o más.

SBGrid Servicios y Recursos:

NIH compatible con el Centro de Servicio SBGrid apoya las operaciones de SBGrid y ofrece a sus miembros el acceso a los siguientes servicios y recursos:

Mantenimiento de Software: El Centro de SBGrid gestiona los ciclos de apoyo de 227 aplicaciones científicas, que incluye:

Evaluación de la aplicación, la recopilación, selección y concesión de licencias; despliegue a través de los 166 laboratorios del Consorcio de más de 2100 estaciones de trabajo; apoyo permanente a más de 1.700 usuarios finales; mantenimiento, mejoras y correcciones de errores para todas las aplicaciones, y rápida transición a nuevas aplicaciones, versiones, notas provisionales y los sistemas operativos compatibles.

Acceso a la informática: Debido a que el descubrimiento de una estructura cristalina a menudo requiere el acceso a los recursos informáticos extensos, SBGrid comenzó la National Science Foundation patrocinó la investigación de la Concertación en 2007 que ofrece un portal informático especializado que los miembros SBGrid utilizar para acceder a la Open Science Grid.

Capacitación: para mantener a los miembros del Consorcio informado sobre los últimos avances en la informática la biología estructural, SBGrid se realizan cada mes seminarios de WebEx y una Escuela de Informática anual, denominado Avances en el Simposio de Biología Estructural de Informática.

SBGrid Developer Network

El Consorcio SBGrid trabaja estrechamente con los desarrolladores de software que diseñan y desarrollan las herramientas de los biólogos estructurales necesitan. Debido a que estos desarrolladores también viven y trabajan en todo el mundo, la integración de sus diversas herramientas de software puede ser un reto. SBGrid ayuda proporcionando recursos, herramientas y una red de desarrolladores amplia "de 20 máquinas virtuales para construir y probar aplicaciones y la integración.

Miembros SBGrid continuamente consultar con los desarrolladores acerca de sus necesidades de cómputo para proyectos futuros. Varios desarrolladores participar en nuestro comité asesor y escuelas SBGrid informática y visítenos en el sitio.

Los participantes en la reunión de asesoramiento más reciente, celebrada en junio de 2011 y con varios días de presentaciones y discusiones, incluidos los desarrolladores de HKL, la focha común, Phenix, resolver / Resolve, CCP4, SHELX y Schrodinger, todas las aplicaciones clave de la biología estructural. Representantes de cuatro sincrotrones de EE.UU. también participaron.

El efecto del modelo de apoyo SBGrid ha sido dramático para sus laboratorios miembros de la suscripción. Apoyo SBGrid ha eliminado la necesidad de un técnico de soporte de software dedicada a los grandes grupos de investigación de biología estructural, mientras que también ayuda a que los grupos más pequeños y menos especializados para crear programas sostenibles de investigación de la biología estructural. Nuestra estimación conservadora del ahorro total realizado por el proyecto es, como mínimo, de $ 2,000,000 / año.









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