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DrugDiscovery: Nuevo proyecto
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About DrugDiscovery@Home:

The purpose of Drugdiscovery@home project is to develop and use the recent in silico methods drug discovery process in the fields of stem cells, aging and cancer. We start from several biotargets. Our project is new and we have just finished all main testing and development stages and just started the calculations so we urgently need computing power to get the first results. Our primary biotargets are proteins participating in Wnt, Shh and Notch signaling pathways. You can read more about it in the Science section. The main purposes of these chemical compounds are: activate signaling pathways(through proteins) which are required for stem-cells self renewal and differentiation into different types of tissues (which is a very important task for regenerative medicine) and other chemicals which can inhibit the proteins which trigger different types of cancer (the goal includes metastasis front cells killing required for cures at metastasis stage). All compounds will be tested in academic and industrial organizations with corresponding fields of research. Our current goal is to validate the methods, get first positive results, publish report as scientific paper and then start more broad usage of the project.
Our primary research interest is the development of new therapies for cancer and gerontology. Our project is powered by an online community of volunteers who donate their computing power to help model drug interactions. When our project is ready, anyone can participate by registering and downloading software to automatically perform analysis. Our project uses the Berkely Open Infrastructure for Networked Computing (BOINC), one of the dominant solutions for running volunteer computing projects. As applications we use now Autodock4.2 virtual screening software, coupled to GROMACs molecular dynamics software. These applications are used for refinement of 3D structures for offline modelled biotargets and in silico structure based drug design. Main innovation of the project is the use of high-performance molecular dynamics for structure based drug design.





Sobre DrugDiscovery@Home:

El propósito del proyecto Drugdiscovery@home, es desarrollar y utilizar los recientes descubrimientos en el proceso del silico para el descubrimiento de métodos de drogas en el ámbito de las células madre, el envejecimiento y el cáncer. Partimos de varios biotargets . Nuestro proyecto es nuevo y acabamos de terminar todas las pruebas principales y las etapas de desarrollo y acaba de comenzar los cálculos, así que necesitamos urgentemente potencia de cálculo para obtener los primeros resultados. Nuestros biotargets primarios, son proteínas que participan en vías de señalización Wnt, Shh y Notch. Puedes leer más sobre esto en la sección de Ciencia. Los objetivos principales de estos compuestos químicos son: activar vías de señalización (a través de las proteínas) que se requieren para que las células madre de auto-renovación y diferenciación en diversos tipos de tejidos (lo cual es una tarea muy importante para la medicina regenerativa) y otros productos químicos que pueden inhibir la proteínas que activar diferentes tipos de cáncer (de la meta incluye células de metástasis delanteros requerida para matar curas en la etapa de metástasis). Todos los compuestos se pondrá a prueba en las organizaciones académicas e industriales con los campos correspondientes de la investigación. Nuestro objetivo actual es validar los métodos, obtener los primeros resultados positivos, publicar el informe como documento científico y luego empezar un uso más amplio de diciembre del proyecto.
Nuestro interés por la investigación primaria es el desarrollo de nuevas terapias para el cáncer y gerontología. Nuestro proyecto es impulsado por una comunidad en línea de voluntarios que donaron su potencia de cálculo para ayudar a modelar interacciones de drogas. Cuando nuestro proyecto está listo, cualquier persona puede participar mediante el registro y la descarga de software para realizar automáticamente análisis. Nuestro proyecto utiliza la Infraestructura Abierta de Berkeley para Computación en Red (BOINC), una de las soluciones dominantes para la ejecución de proyectos de voluntariado de computación. Como las aplicaciones que utilizamos ahora Autodock4.2 software cribado virtual, sumado a la dinámica molecular GROMACS software. Estas aplicaciones se utilizan para el refinamiento de las estructuras 3D para modelado y fuera de línea biotargets diseño in silico estructura fármaco basado. La innovación principal del proyecto es el uso de altas prestaciones dinámicas moleculares para la estructura de la base de drogas design.C@Home es un contenedor entre BOINC y distributed.net.
Lo que significa es que DNETC BOINC está funcionando en aplicaciones en el que se puede elegir un proyecto a ejecutarse desde el entorno Distributed.Net. Lo mejor de ambos mundos realmente. En el momento de este artículo no tienen Unidades de Trabajo, solamente para la GPU.




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Url proyecto: http://drugdiscoveryathome.com/

Url equipo: http://boinc.drugdiscoveryathome.com/team_display.php?teamid=54

Server status: http://drugdiscoveryathome.com/?q=node/30



Enviado el: 21/4/2009 17:02

Editado por ljfc2001 enviado el 17/9/2012 22:27:16
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Re: DrugDiscovery
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¿Quién invita?

Enviado el: 21/4/2009 18:52
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Re: DrugDiscovery
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genial que saquen nuevos proyectos de esta índole ;)

de donde sacamos las invitaciones? XD a ver si hacen como los de docking, que abrieron la creación de cuentas durante 24H

Enviado el: 21/4/2009 18:55
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Re: DrugDiscovery
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¿¿¿Quién me invita

Enviado el: 21/4/2009 20:07
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Re: DrugDiscovery
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Hay que escribir un mail al administrador del proyecto.


EDITO: Acabo de hacer una petición, a ver que me dicen.

Enviado el: 21/4/2009 22:48

Editado por Califa enviado el 21/4/2009 23:07:31
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Re: DrugDiscovery
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Es el tal...Jack Shultz?...el que tiene una lamparilla en la cabeza jejeje.

No veo su dirección, estoy torpe


Ya estamos de terceros....bueno estás...tu solito

Enviado el: 21/4/2009 23:14
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Re: DrugDiscovery
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Sir. Califa, podrías darme la dirección? No veo como conseguir una invitación

Enviado el: 26/4/2009 0:12
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Re: DrugDiscovery
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No tengo su mail. Le envié un mensaje privado por el foro del proyecto. Me contestó diciendo que no era él el que daba las invitaciones, así que lo iba a comentar con el responsable del proyecto.

Enviado el: 26/4/2009 0:47
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Re: DrugDiscovery
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Algún compañero con Mac o Linux que quiera procesar en este proyecto?. Me ofrecen invitaciones para estas plataformas.

Enviado el: 5/5/2009 10:22
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Re: DrugDiscovery
Guest_
trae paca esa invitacion quillo!!

tengo una maquina con ubuntu32 y otra con ubuntu64

saludos

Enviado el: 5/5/2009 10:59
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Re: DrugDiscovery
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y yo el mac ;)

Enviado el: 5/5/2009 12:02
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Re: DrugDiscovery
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Hola Rafa:



Si te llegaran a dar alguna invitación para Windows no te olvides de este modesto servidor.

Agradecido.


Gastón.

Enviado el: 5/5/2009 12:44
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¿Cuánto hemos aportado a la ciencia simplemente desde la comodidad de nuestros hogares? Con tan poco podemos cambiar el rumbo de las cosas o al menos intentarlo...y en eso estoy.
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Re: DrugDiscovery
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Our project Designs and Tests prospective drug-like compounds for regulation of signaling pathways involved in tissue engineeering and cancer. Currently we are benchmarking Autodock on Lysozyme and H1N1 Neurominidase.

"nuestro proyecto diseña y prueba compuestos con potencial farmacológico para la regulación y señalización de rutas involucradas en el desarrollo de tejidos y el cáncer. Actualmente estamos poniendo a punto Autodock con la lisozima y la neuroaminidasa de H1N1"

Enviado el: 8/5/2009 9:51
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Re: DrugDiscovery
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¿como quedó el asunto de las invitaciones?

Enviado el: 12/5/2009 20:20
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Re: DrugDiscovery
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Pues no me han contestado aún. Escribiré de nuevo.

Enviado el: 12/5/2009 22:32
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