About FightMalaria@Home:

FightMalaria@Home is a research project that uses donated CPU time to perform docking simulations on malaria proteins. You can participate by downloading and running a free program on your computer.

By participating in this project you are agreeing to our terms of use.

FMAH is based in UCD CASL..


Crowd-sourcing antimalarial drug discovery

Goal:

To discover novel targets for antimalarial drugs.

Context:

Malaria kills a child every 45 seconds. The disease is most prevalent in poorer countries, where it infects 216 million people and kills 650,000 each year, mostly African children under 5 years old [WHO]. And Plasmodium falciparum continues to evolve resistance to available medication. We therefore urgently need to discover new drugs to replace existing drugs. Importantly, these new drugs need to target NEW proteins in the parasite. The FightMalaria@Home project is aimed at finding these new targets.

Resources:

The Plasmodium falciparum genome has been sequenced, the proteome has been mapped, and protein expression has been confirmed at various stages in this apicoplexan's life cycle. Numerous crystal structures of target proteins are also available, and the remainder have been modelled using available structural templates. Excitingly, large research organisations (GSK, Novartis) have already tested millions of compounds and found more than 18,000 hits that show promising activity against Plasmodium falciparum [MMV]. But they don't know which target protein is inhibited by these compounds. Drug discovery and development will be significantly enhanced by knowing the target protein for each of these hits.

Problem:

We plan to dock each of the 18,924 hits into structures of each of the 5,363 proteins in the malaria parasite. The computational power needed is enormous.

Solution:

We aim to harness the donated computational power of the world's personal computers. Most computers only use a fraction of their available CPU power for day-to-day computation. We have built a BOINC server that distributes the docking jobs to donated 'client' computers, which then do the work in the background. By connecting 1000s of computers this way, we'll be able harness the equivalent power of large supercomputers. If you would like to get involved, please follow the very quick installation instructions here.







Sobre FightMalaria@Home:

FightMalaria@Home es un proyecto de investigación que usa el tiempo donado CPU para realizar simulaciones de acoplamiento de proteínas de la malaria. Puede participar descargando y ejecutando un programa gratuito en su ordenador.

Al participar en este proyecto, acepta que está de acuerdo con nuestros términos de uso.

FMAH está basado en UCD CASL..



Descubrimiento de fármacos contra la malaria

Meta:

Descubrir nuevos objetivos para fármacos antipalúdicos.

Contexto:

La malaria mata un niño cada 45 segundos. Es la enfermedad que más prevalece en los países más pobres, donde infecta a 216 millones de personas y mata a 650.000 cada año, la mayoría de los niños africanos menores de 5 años de edad [OMS]. La Plasmodium falciparum sigue evolucionando la resistencia a los medicamentos disponibles. Por lo tanto, se necesita con urgencia, descubrir nuevos medicamentos para reemplazar a los medicamentos existentes. Es importante destacar que estos nuevos medicamentos deben dirigirse a nuevas proteínas contra el parásito. El proyecto FightMalaria@Home está dirigido a la búsqueda de estos nuevos objetivos.

Recursos:

El genoma Plasmodium falciparum, ha sido secuenciado, el proteoma se ha asignado, y la expresión de la proteína ha sido confirmada en las diversas etapas del ciclo de vida de este apicoplexan. Numerosas objetivos de estructuras cristalinas de proteínas, también están disponibles, y el resto han sido modeladas utilizando las plantillas disponibles estructurales. Magnífico, las grandes organizaciones de investigación (GSK, Novartis) ya han probado millones de compuestos y se localizaron más de 18.000 visitas que muestran una actividad prometedora contra el Plasmodium falciparum [MMV]. Pero ellos no saben que la proteína objetivo es inhibida por estos compuestos. El descubrimiento de fármacos y el desarrollo será mucho mejor al saber la proteína objetivo para cada uno de estos accesos.

Problema:

Tenemos la intención de acoplar cada una de las 18.924 visitas en las estructuras de cada una de las 5.363 proteínas en el parásito de la malaria. La potencia de cálculo necesaria es enorme.

Solución:

Nuestro objetivo es aprovechar el poder de cómputo donado de los ordenadores personales de todo el mundo. La mayoría de los ordenadores sólo utilizan una fracción de su poder de CPU disponible, para el cálculo de las tareas diarias. Hemos construido un servidor BOINC, que distribuye los trabajos de acoplamiento, a la donación de los clientes de los ordenadores, que luego hacen el trabajo en segundo plano. Mediante la conexión de 1.000 de los ordenadores de esta manera, vamos a ser capaces de controlar la potencia equivalente de los superordenadores de gran tamaño. Si desea participar, por favor, siga las instrucciones de instalación.





Vina:

Microsoft Windows (98 or later) running on an Intel x86-compatible CPU 2.00.

Linux running on an Intel x86-compatible CPU 2.00.

Mac OS 10.4 or later running on Intel.





Url proyecto: http://boinc.ucd.ie/fmah/index.php

Url equipo: http://boinc.ucd.ie/fmah/team_display.php?teamid=66

Server status: http://boinc.ucd.ie/fmah/server_status.php

Hola. Me he apuntado a este proyecto y creo que somos numero 1 hispano. He ido a mirarlo en la web de estadísticas pero veo que no lo tenemos dado de alta.

¿Podéis añadirlo a la web de estadísticas para que así veamos nuestros progresos? Gracias

Hasta que lo pongan lo pudes ir viendo por aquí:

http://www.allprojectstats.com/top.php?s=0&projekt=146&type=2

O por cualquier otra de estas páginas:

http://boinc.ucd.ie/fmah/stats.php

Creo que lo tiene que hacer JL, cuando regrese de sus vacances.

Gracias por la info.

Ya he podido comprobar que efectivamente somos los número 1 hispanos y estamos en la posición 36 del mundo.

Somos tres los miembros activos:

ljfc2001
Agus
borjarp

Así que animaros el resto y apuntaros

Acabo de recibir mi primera unidad de FightMalaria@Home
¿Puede durar 4 minutos una de estas unidades? en mi caso 00:04:44, programa vina 3.0.

Son unidades cortas, sobre 6.000 seg en un core a 2.4 Ghz.

En este momento mi Boinc Manager tiene 62 unidades de FightMalaria@Home , "Listas para comenzar", "Ejecutando" y "Listas para informar", aunque estoy muy conforme con mi AMD Fusion lamento no tener un AMD FX-8150 con sus 8 nucleos porque talvez mi Boinc Manager tendria 496 unidades de FightMalaria@Home.