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WCG:Schistosomiasis
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Enviado el: 22/2/2012 18:58

Editado por Fer314 enviado el 22/2/2012 21:49:31
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Re: WCG:Schistosomiasis
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Te me adelantaste fer, segun vi la nueva unidad me propuse hacer lo misco que tu.. .-), para el siguiente proyecto. Unos que acaba (Help cure muscular distrophy), esta ya recogiendo las ultimas unidades. y otros que empieza. El ciclo de la vida. .-)).

Habra que ver como son las unidades. Yo en este momento estoy dandole al human proteome folding fase 2 que despues de los de cancer me parece de los mas interesantes, mas que nada porque segun tengo entendido estan relacionados la interaccion de las proteinas con algunos tipos de cancer.

Un saludo compañeros y a seguir la lucha con htcmania.

Enviado el: 22/2/2012 19:48
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Nuevo proyecto WCG: Say No to Schistosoma
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About, Say No to Schistosoma:


Project Status and Findings:
Information about this project is provided on the web pages below and by the project scientists on the Say No to Schistosoma website. If you have comments or questions about this project, please visit the Say No to Schistosoma forum.

Mission:
The mission of the Say No to Schistosoma project is to identify potential drug candidates that could possibly be developed into treatments for schistosomiasis. The extensive computing power of World Community Grid will be used to perform computer simulations of the interactions between millions of chemical compounds and certain target proteins. This will help find the most promising compounds that may lead to effective treatments for the disease.

Significance:
Schistosomiasis is a tropical disease caused by parasitic worms that are transmitted by freshwater snails. The disease kills 200,000 people each year and affects over 207 million people. Schistosomiasis is second only to malaria in its socioeconomic devastation. Researchers at the Infórium University in Belo Horizonte and FIOCRUZ-Minas, Brazil, are using World Community Grid to search for chemical compounds which may lead to new drugs for treating the disease.

Approach:
A software program called VINA from The Scripps Research Institute in La Jolla, California, will be used to perform the virtual chemistry experiments. These virtual experiments will search to find which of millions of drug compounds might be able to disable particular proteins essential for the parasite's survival. Screening for the best potential drug compounds is an early step in the process of developing effective treatments for the disease. With enough computing power, this screening can be done much more quickly than using conventional laboratory experiments. Existing computers available to the researchers would require approximately 30 years to perform the screening. However, it is estimated that the power of World Community Grid can reduce the time required to one year or less. Information about the best candidate compounds will be published by the scientists, and this information will be available in the public domain for other scientists to build upon with their research. Further laboratory work using the best candidates identified by this project could lead to the development of better drugs to fight schistosomiasis.


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Sobre, Di no a la infección por Schistosoma:


ESTADO Y RESULTADOS del Proyecto:
Información acerca de este proyecto se ofrece en las páginas web y por debajo de los científicos del proyecto en el decir no a la página web Schistosoma. Si tiene comentarios o preguntas acerca de este proyecto, por favor visite el foro de Di no a la infección por Schistosoma.

Mision:
La misión de la Di no al proyecto de Schistosoma es identificar a los posibles candidatos de fármacos que podrían ser desarrollados en los tratamientos para la esquistosomiasis. La gran potencia de cálculo de World Community Grid se utilizará para llevar a cabo simulaciones por ordenador de las interacciones entre los millones de compuestos químicos y ciertas proteínas diana. Esto le ayudará a encontrar los compuestos más prometedores que podrían conducir a tratamientos efectivos para la enfermedad.

Significado:
La esquistosomiasis es una enfermedad tropical causada por parásitos que se transmiten por caracoles de agua dulce. La enfermedad mata a 200.000 personas cada año y afecta a más de 207 millones de personas. La esquistosomiasis es sólo superada por la malaria en su devastación socioeconómica. Investigadores de la Universidad Infórium en Belo Horizonte y Minas-FIOCRUZ, Brasil, está utilizando World Community Grid para buscar compuestos químicos que pueden llevar a nuevos fármacos para el tratamiento de la enfermedad.

Enfoque:
Un programa de software llamado Viña del Instituto de Investigación Scripps en La Jolla, California, será utilizado para llevar a cabo los experimentos de química virtual. Estos experimentos virtuales búsqueda para encontrar cuál de millones de compuestos de la droga podría ser capaz de desactivar determinadas proteínas esenciales para la supervivencia del parásito. La detección de los compuestos de los mejores potenciales de los medicamentos es un primer paso en el proceso de desarrollo de tratamientos efectivos para la enfermedad. Con suficiente poder de cómputo, este examen se puede hacer mucho más rápidamente que el uso de experimentos de laboratorio convencionales. Equipos existentes a disposición de los investigadores requeriría aproximadamente 30 años para realizar la proyección. Sin embargo, se estima que la potencia de World Community Grid puede reducir el tiempo requerido para un año o menos. La información sobre los compuestos de los mejores candidatos será publicada por los científicos, y esta información estará disponible en el dominio público para que otros científicos se basan en sus investigaciones. El trabajo de laboratorio utilizando los mejores candidatos identificados por este proyecto podría conducir al desarrollo de mejores medicamentos para combatir la esquistosomiasis.


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Url WCG Say No to Schistosoma: aquí.

Url WCG Say No to Schistosoma Forum: aquí.

Schistosoma Wiki: aquí.

Performance Chart Evolution: aquí.



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About the Project:

Schistosomiasis is a tropical disease caused by parasitic worms, which kills as many as 200,000 people per year and affects over 207 million people in 74 countries. To date, there are no available vaccines to prevent the disease, despite extensive research. Schistosomiasis is second only to malaria in its socioeconomic devastation.

The disease is caused by parasitic trematode worms (genus Schistosoma). The parasite's larvae, released by freshwater snails, penetrate the skin and eventually travel to the liver via the blood stream. Feeding on the host's blood, the parasites mature and move through the veins to other parts of the body such as the bladder and intestines. During their lifetime, which can be decades, they can produce hundreds of eggs per day. Some of the eggs are excreted in urine or feces, then hatch and infect more snails.

The body's immune response to the eggs, which remain in the body, is the main cause of the disease. The immune response is the body's natural defense mechanism to foreign invaders and normally causes temporary inflammation of the affected tissues. However, the disease causes continued inflammation, which damages the affected organs and so the problem becomes more severe. Schistosomiasis can affect various organs such as the liver, spleen, intestine, and kidneys, and can lead to death. One species of Schistosoma can also cause bladder cancer.


Antimony, oxamniquine, mirazid, and metrifonate are drugs that have been used to treat schistosomiasis, but these drugs are either not highly effective, have been discontinued, or work against only certain forms of the disease. An orally administered drug called praziquantel is currently the best treatment for schistosomiasis. However, there is evidence that Schistosoma may become resistant to praziquantel. For these reasons, there is an urgent need to develop new treatments.

To accelerate the search for potential drugs against schistosomiasis, the computing power of World Community Grid will be used to screen millions of potential chemical compounds as possible drug treatment candidates. Instead of performing expensive and time-consuming laboratory experiments, simulations of these millions of experiments will be performed using software running on World Community Grid's member computers.

A software program called VINA from The Scripps Research Institute in La Jolla, California, will be used to perform the virtual chemistry experiments, more precisely known as molecular dockings. Molecular docking is the process of determining how well two chemical compounds bind together. One of the chemical compounds is designated as the target, in this case one of several proteins essential for the parasite's survival. The other compound is one from a collection of millions of compounds from various databases, cataloging known compounds and their exact atomic structure. The docking experiments position the two compounds in all possible orientations, computing the binding energy for each, which tells how well they stick together in that configuration. If a compound binds to the target protein, it may be useful in disabling the function of that protein and thus the progress of the disease. The researchers are identifying Schistosoma proteins to be used for the project and are determining the atomic structure of those proteins so they can be used as targets for the molecular docking experiments.

The VINA calculations will be used to identify the most promising chemical compounds that may inhibit these proteins. The computations involved are very intensive and would take over 30 years to complete using computers normally available to the researchers. World Community Grid will be able to reduce the time required to test the millions of compounds against these proteins to one year or less. Information about the best candidate compounds will be published by the scientists, and this information will be placed in the public domain for other scientists to build upon with their research. The research team plans to conduct additional laboratory work using the best candidates identified by the VINA computations, which could lead to the development of better drugs to fight schistosomiasis.


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Sobre el Proyecto:

La esquistosomiasis es una enfermedad tropical causada por gusanos parásitos, que mata a más de 200.000 personas al año y afecta a más de 207 millones de personas en 74 países. Hasta la fecha, no existen vacunas disponibles para prevenir la enfermedad, a pesar de una extensa investigación. La esquistosomiasis es sólo superada por la malaria en su devastación socioeconómica.

La enfermedad es causada por gusanos trematodos parásitos (del género Schistosoma). Las larvas del parásito, publicado por caracoles de agua dulce, penetran en la piel y, finalmente, viajan hasta el hígado a través del torrente sanguíneo. La alimentación en la sangre del huésped, los parásitos madurar y moverse a través de las venas de otras partes del cuerpo, tales como la vejiga y los intestinos. Durante su tiempo de vida, que puede ser décadas, se puede producir cientos de huevos por día. Algunos de los huevos son excretados en la orina o las heces, entonces eclosionan e infectar a más caracoles.

La respuesta inmune del organismo a los huevos, que permanecen en el cuerpo, es la principal causa de la enfermedad. La respuesta inmune es el mecanismo de defensa natural del cuerpo a los invasores extranjeros y por lo general causa inflamación temporal de los tejidos afectados. Sin embargo, la enfermedad causa inflamación continua, lo que daña los órganos afectados y por lo tanto el problema se vuelve más grave. La esquistosomiasis puede afectar a diversos órganos como el hígado, el bazo, el intestino y los riñones, y puede conducir a la muerte. Una de las especies de Schistosoma también puede causar cáncer de vejiga.


Antimonio, oxamniquina, Mirazid y metrifonato son fármacos que se han utilizado para tratar la esquistosomiasis, pero estos medicamentos son muy eficaces, o no, se han suspendido, o en el trabajo contra sólo ciertas formas de la enfermedad. Un medicamento administrado por vía oral llamado praziquantel es actualmente el mejor tratamiento para la esquistosomiasis. Sin embargo, existe evidencia de que Schistosoma pueden hacerse resistentes a prazicuantel. Por estas razones, existe una urgente necesidad de desarrollar nuevos tratamientos.

Para acelerar la búsqueda de fármacos potenciales contra la esquistosomiasis, la potencia de cómputo de World Community Grid se utilizará para la pantalla de millones de compuestos químicos como los posibles candidatos posibles de tratamiento de drogas. En lugar de realizar experimentos de laboratorio costosos y requerir mucho tiempo, las simulaciones de estos millones de experimentos se realizaron utilizando el software que se ejecuta en los equipos miembros de World Community Grid.

Un programa de software llamado Viña del Instituto de Investigación Scripps en La Jolla, California, será utilizado para llevar a cabo los experimentos de química virtual, más precisamente conocido como acoplamientos moleculares. De acoplamiento molecular es el proceso de determinar qué tan bien los dos compuestos químicos se unen entre sí. Uno de los compuestos químicos se designa como la diana, en este caso una de varias proteínas esenciales para la supervivencia del parásito. El otro compuesto es uno de una colección de millones de compuestos de varias bases de datos, la catalogación de los compuestos conocidos y su estructura atómica exacta. La posición de acoplamiento experimentos de los dos compuestos en todas las orientaciones posibles, calcular la energía de enlace para cada uno, que le dice lo bien que se pegan en esa configuración. Si un compuesto se une a la proteína diana, puede ser útil en desactivación de la función de esa proteína y por lo tanto el progreso de la enfermedad. Los investigadores están identificando proteínas Schistosoma que se utilizará para el proyecto y se determina la estructura atómica de estas proteínas para que puedan ser utilizados como objetivos para los experimentos de acoplamiento molecular.

Los cálculos VIÑA se utiliza para identificar los compuestos químicos más prometedores que pueden inhibir estas proteínas. Los cálculos que son muy intensivos y que tomaría más de 30 años para completar el uso de computadoras destinadas normalmente a los investigadores. World Community Grid será capaz de reducir el tiempo necesario para probar los millones de compuestos contra estas proteínas a un año o menos. La información sobre los compuestos de los mejores candidatos será publicada por los científicos, y esta información se colocará en el dominio público para que otros científicos se basan en sus investigaciones. El equipo de investigación planea llevar a cabo el trabajo de laboratorio adicional con los mejores candidatos identificados por los cálculos de Viña, lo que podría conducir al desarrollo de mejores fármacos para combatir la esquistosomiasis.

Enviado el: 22/2/2012 20:03

Editado por ljfc2001 enviado el 22/2/2012 20:36:13
Editado por ljfc2001 enviado el 22/2/2012 20:43:23
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Editado por ljfc2001 enviado el 22/2/2012 22:18:50
Editado por ljfc2001 enviado el 22/2/2012 22:30:06
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Re: WCG:Schistosomiasis
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Jajaja, pues al final nos hemos duplicado la información y casi triplicado. Así da gusto.

Pues como comenta baker están a punto de finalizar Help Cure Muscular Dystrophy - Phase 2 y a Help Conquer Cancer le queda muy poco.

¿Alguíen tiene tareas ya?

Enviado el: 22/2/2012 20:49
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Re: WCG:Schistosomiasis
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Yo tengo varias tareas ya, a mi me en principio en mi PC me tardan 12 horas cada wu.

Enviado el: 22/2/2012 20:52
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Re: WCG:Schistosomiasis
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Jajaja casi casi me pillais ;)

Si os fijais aquí, teneis el tiempo que más o menos les queda a los proyectos, no es exacto pero da una idea de cómo van.

http://www.worldcommunitygrid.org/for ... g/viewthread?thread=18277

http://i137.photobucket.com/albums/q2 ... ob/WCGYearsPi1Project.png

Si no pasa nada 4 proyectos acabarán este año aunque ya dejaron caer que vendrán otros tantos como ya estamos viendo y como suele ser habitual.

Me queda como un mes para colgarme la medalla esmeralda en el de malaria y ya le tiro a éste.

Saludos

PD. me he despistado y creo que este mensaje puede salir duplicado, si es así pido que se borre ;)

Enviado el: 22/2/2012 21:51
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Re: WCG:Schistosomiasis
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Yo suelo ver estos gráficos individuales para enterarme:

http://www.worldcommunitygrid.org/for ... g/viewthread?thread=26012

Ves como evolucionan los gráficos, abajo indica el porcentaje que falta para completar.

Enviado el: 22/2/2012 22:13
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Re: WCG:Schistosomiasis
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También miro ésos de vez en cuando aunque me gusta más el gráfico general que he puesto antes ya que así veo al mismo tiempo todos los proyectos.

Están muy completos la verdad.

Enviado el: 22/2/2012 22:32
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Re: WCG:Schistosomiasis
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Schistosoma

Schistosoma es un género de platelmintos parásitos de la clase trematodas, comúnmente llamados bilharzia. Causan la infección más importante del hombre de entre todos los gusanos planos, conocida como esquistosomiasis. La fase adulta fue descubierta en un paciente de Egipto en 1851 durante una autopsia hecha por el Dr. Theodore Maximilian Bilharz. Todas las especies de Schistosoma tienen a un molusco como hospedador intermedio, una relación que fue descubierta a comienzos del siglo XX. En África, después de la malaria, es la enfermedad tropical mas prevalente en el hombre y de gran importancia socio-económica y en salud pública para países en vías de desarrollo. Se encuentra prevalente en 3/4 partes de los países en desarrollo y más del 80% de los afectados viven en el África al sur del Sahara


Esquistosomiasis

La esquistosomiasis (antiguamente llamada bilharziasis o bilharziosis) es una enfermedad parasitaria producida por gusanos platelmintos de la clase trematodos del género Schistosoma (castellanizado esquistosoma). Es relativamente común en los países en vías de desarrollo, especialmente en África; aunque su tasa de mortalidad es baja, la esquistosomiasis es altamente incapacitante debido a las fiebres con que se manifiestan.

Los expertos de la OMS estiman que 160 millones de personas padecen esquistosomiasis. La enfermedad causa decenas de miles de defunciones cada año, principalmente en el África subsahariana

Enviado el: 22/2/2012 22:45
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Re: WCG:Schistosomiasis
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Podríamos llamar a este hilo:

Nuevo proyecto WCG: Say No to Schistosoma (comentarios)...por ejemplo. Si a Fer le parece bién, así no tenemos hilos, parace que duplicados, diferenciamos uno de información y otro de cometarios, puntuaciones, medallas, etc.

Enviado el: 22/2/2012 22:51
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Re: WCG:Schistosomiasis
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No me había dado cuenta de que ya habias creado un hilo con información del proyecto. Creo que lo mejor será unir los dos hilos.

Enviado el: 22/2/2012 22:56
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Re: WCG:Schistosomiasis
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El foro se ha hecho un lío a la hora de fusionar los dos hilos, así que mejor, si no os importa, continuamos en este.

Enviado el: 22/2/2012 23:09
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Re: WCG:Schistosomiasis
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Podríamos llamar a este hilo:

Nuevo proyecto WCG: Say No to Schistosoma (comentarios)...por ejemplo. Si a Fer le parece bién, así no tenemos hilos, parace que duplicados, diferenciamos uno de información y otro de cometarios, puntuaciones, medallas, etc.


A mi me parece bien ;)

Y así dejamos el otro que ha puesto Califa para noticias sobre el proyecto, su evolución, etc...

Saludos

Enviado el: 22/2/2012 23:19
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